Αθώοι κρίθηκαν από το δικαστήριο ο πρύτανης και δύο αντιπρυτάνεις του ΕΜΠ την περίοδο 2006-2010, οι οποίοι είχαν κατηγορηθεί για παράβαση καθήκοντος, επειδή

ο δικτυακός τόπος Indymedia Athens φιλοξενείται σε διακομιστή του Πολυτεχνείου. Οι τρεις πανεπιστημιακοί επισήμαναν ότι δεν είχαν τη δικαιοδοσία να λογοκρίνουν το δίκτυο εναλλακτικής ενημέρωσης, και χαιρέτισαν την απόφαση ως νίκη για την ελευθερία του λόγου.

Κατηγορούμενοι στην υπόθεση ήταν ο τέως πρύτανης Κώστας Μουτζούρης και οι αντιπρυτάνεις Ι.Πολύζος και Γ.Σπαθής. Και οι τρεις δήλωσαν στο Τριμελές Πλημμελειοδικείο ότι δεν είχαν την τεχνική ή νομική υποχρέωση να σταματήσουν τη φιλοξενία του Indymedia, παρόλο που οι ίδιοι προσωπικά καταδικάζουν πολλά από δημοσιεύματά του.

Επισήμαναν δε ότι αρμόδιοι για την εν λόγω διαδικασία ήταν η Διεύθυνση Ηλεκτρονικού Εγκλήματος και οι αρμόδιοι εισαγγελείς. Μάλιστα χαρακτήρισαν «πολιτική» τη δίωξή τους με την κατηγορία της παράβασης καθήκοντος με σκοπό το «παράνομο ηθικό όφελος».

Απαλλακτική για τους καθηγητές ήταν και η εισαγγελική πρόταση.

Ως μάρτυρες υπεράσπισης κατέθεσαν ο νυν πρύτανης του ΕΜΠ κ. Σιμόπουλος και ο πρόεδρος της Δημοκρατικής Αριστεράς Φώτης Κουβέλης, ο οποίος δήλωσε στο δικαστήριο πως «ο χώρος της ακαδημαϊκής ελευθερίας πρέπει να επεκτείνεται στα ακραία όρια, γιατί μόνο τότε είναι ελευθερία».

Συμφώνησε με τη θέση ότι οι πρυτανικές αρχές δεν είχαν δυνατότητα να επέμβουν.

Μετά το τέλος της δίκης, οι τρεις πανεπιστημιακοί δήλωσαν ότι «με την απόφαση, η έννοια της ελευθερίας του λόγου και του πανεπιστημιακού ασύλου γίνονται πιο δυνατές».  Η δίωξη των πρυτανικών αρχών το 2009 είχε προκαλέσει την αντίδραση και της υπουργού Παιδείας Άννας Διαμαντοπούλου, η οποία είχε δηλώσει τότε ότι «πάνω από όλα είναι η ελευθερία της εκφρασης».
Newsroom ΔΟΛ, με πληροφορίες από ΑΠΕ-ΜΠΕ